Unbefristet | In Vollzeit mit 38,5 Wochenstunden | Vergütung nach TV-L | Institut für Medizinische Mikrobiologie
Wir sind das UKM. Wir haben einen klaren gesellschaftlichen Auftrag und mit der Verbindung von Krankenversorgung, Forschung und Lehre eine besondere Verantwortung.
Damit wir unserem hohen Anspruch tagtäglich gerecht werden, freuen wir uns auf Deine fachliche Kompetenz im Institut für Medizinische Mikrobiologie – am besten mit Dir!
VERANTWORTUNGSVOLLE AUFGABEN:
1. Aufbau einer Diagnostik-Infrastruktur zu "microbial cell free DNA sequencing"; Unterstützung bei der Etablierung neuer DNA-basierter Diagnostika
2. Aufbau einer Sequenzierplattform (Oxford Nanopore) zur schnellen Vorhersage von Antibiotikaresistenzen (z.B. Mycobacterium tuberculosis)
3. Vernetzung mit bestehenden Sequenzierplattformen an der Medizinischen Fakultät (z.B. Institut für Hygiene)
4. Etablierung einer Metagenomic-Plattform für Foschung und Routinediagnostik (Oxford Nanopore)
5. Vernetzung mit dem "Medical Data Integration Center" (MeDIC) in Münster, um Patientendaten im Rahmen von KI-Projekten für die mikrobiologische Diagnostik nutzbar zu machen
ANFORDERUNGEN:
6. Abgeschlossenes Studium in Bioinformatik / Biotechnologie
7. Kenntnisse in Scriptsprachen wie z.B. Python und der Linux-Kommandozeile (Bash)
8. Erfahrung mit bioinformatischen Pipeline-Systemen wie Nextflow oder Snakemake wünschenswert
9. Erfahrung in der Auswertung von Next- oder Third-Generation-Sequencing-Daten wünschenswert
10. Gute Deutsch- und Englischkenntnisse
11. Hohes Maß an Motivation, Eigeninitiative und Verantwortungsbewusstsein
WIR BIETEN:
12. Attraktiver Arbeitsplatz an der Schnittstelle zwischen Patientenversorgung und Forschung
13. Mitarbeit in einem interdisziplinären Team und in enger Kooperation mit externen Kooperationspartnern
14. Möglichkeit, einen zukunftsträchtigen und innovativen Bereich in der molekularen Diagnostik zu gestalten und aufzubauen
Rückfragen an: Univ.-Prof. Frieder Schaumburg, T 0251 83-52767
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