Das Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften – ISAS – e.V. entwickelt leistungsfähige Analyseverfahren für die Gesundheitsforschung. Mit seinen Innovationen trägt es dazu bei, die Prävention, Frühdiagnose und Therapie von beispielsweise Herz-Kreislauf-Erkrankungen, Autoimmunerkrankungen oder Krebs zu verbessern. Ziel des Instituts ist es, die personalisierte Therapie voranzutreiben. Dafür kombinieren wir am ISAS das Wissen aus Biologie, Chemie, Pharmakologie, Physik und Informatik. Das ISAS ist Mitglied der Leibniz-Gemeinschaft und wird durch die Bundesrepublik Deutschland und ihre Länder öffentlich gefördert. An unserem Standort in Dortmund suchen wir eine/n Doktorand:in (m/w/d): Analysis of Microscopic BIOMedical Images (AMBIOM) Ein neues Projektgebiet im Institut ist die Entwicklung von Künstlicher Intelligenz (KI)-Software für topologie-informierte biomedizinische Bildanalyse und große Foundation-Modelle. Ihre Aufgaben: Entwicklung neuer Machine-Learning-Algorithmen für die Analyse von Mikroskopiebilddaten (2D/3D/4D/5D), basierend auf realen Anwendungen in der lebenswissenschaftlichen Forschung Entwicklung von Lösungen zur Integration großer Foundation-Modelle in Workflows zur Mikroskopiebildanalyse und analytischen Datenanalyse gemeinsam mit anderen Teammitgliedern Implementierung KI-basierter Software zur Mikroskopiebildanalyse als Python Entwicklung von Algorithmen zur Integration topologischer Einschränkungen in KI-Modelle Publikation von Ergebnissen und Methoden in Konferenzbeiträgen und Fachzeitschriften Ihr Profil: Master-, Diplom- oder gleichwertiger Abschluss in Informatik/Computer Engineering/Statistik/angewandter Mathematik/Data Science/Biomedizintechnik oder in einem relevanten wissenschaftlichen Bereich Fundierte Kenntnisse im Bereich maschinelles Lernen Umfassende Erfahrung im Bereich Computer Vision oder Bildanalyse Gute Kenntnisse in Deep-Learning-Paketen wie PyTorch Erfahrung mit Foundation-Modellen (Large Vision Models oder multimodalen Large Language Models) Kenntnisse grundlegender topologischer Konzepte Gute Präsentations- und Schreibfähigkeiten Proaktive, eigenständige und lösungsorientierte Arbeitsweise Fließendes Englisch (in Wort und Schrift) Veröffentlichungen bei hochrangigen Computer-Vision-Konferenzen oder in Fachzeitschriften sind von Vorteil Erfahrung in der Entwicklung von Open-Source-Software ist von Vorteil Wir bieten: Ein klares Forschungsthema sowie eine vielseitige Ausbildung und Betreuung von Doktoranden am ISAS und im Rahmen der Leibniz-Gemeinschaft Fortbildungs- und wissenschaftliche Entwicklungsmöglichkeiten in einem internationalen Umfeld und eine hervorragende Arbeitsatmosphäre in einem sehr dynamischen und professionellen Team Umfangreiche Ausstattung und Infrastruktur auf dem neuesten Stand der Technik in verschiedenen analytischen Methoden Die Möglichkeit, Ihre Daten auf internationalen Konferenzen zu präsentieren und an Workshops teilzunehmen Flexible Arbeitszeiten, mobiles Arbeiten und attraktive Sozialleistungen; Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie (u.a. Suche nach Kinderbetreuungseinrichtungen sowie Kurzzeitbetreuung, Beratung bei der Pflege von Angehörigen) durch einen Familienservice; Betriebliche Gesundheitsförderung sowie die Förderung der Teilnahme an Sportangeboten der TU Dortmund Die Vergütung erfolgt in Anlehnung an den TV-L. Die Vollzeitstelle ist ab sofort verfügbar und befristet auf 3,5 Jahre. Die Befristung des Vertrages richtet sich nach dem Wissenschaftszeitvertragsgesetz (WissZeitVG). Frauen werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt berücksichtigt, sofern Frauen in der jeweiligen Organisationseinheit unterrepräsentiert sind und nicht in der Person eines Mitbewerbers liegende Gründe überwiegen. Bewerbungen von für die Position qualifizierten schwerbehinderten oder diesen gleichgestellten Personen werden ausdrücklich begrüßt. Das ISAS erhebt und verarbeitet die persönlichen Daten seiner Bewerber:innen gemäß den europäischen und deutschen gesetzlichen Bestimmungen. Weitere Informationen zum Datenschutz und zur Verarbeitung personenbezogener Daten erhalten Sie unter www.isas.de/datenschutzhinweise-fuer-bewerberinnen-und-bewerber. Einsendeschluss für die Bewerbung ist der 05.03.2025. Bitte bewerben Sie sich über unser Bewerbungsportal. Bei Fragen (Verf.-Nr.341_2025) wenden Sie sich gerne an die Personalabteilung (bewerbungenisas.de). Nähere Informationen über das Institut finden Sie unter: http://www.isas.de. The Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften - ISAS - e. V. develops efficient analytical methods for health research. Thus, it contributes to the improvement of the prevention, early diagnosis, and therapy of diseases like cardiovascular diseases, autoimmune diseases or cancer. Overall, the institute strives to advance precision medicine by combining knowledge from different fields such as biology, chemistry, pharmacology, physics, and computer science. ISAS is a member of the Leibniz Association and is publicly funded by the Federal Republic of Germany and its federal states. At our location in Dortmund, we invite applications for a PhD Candidate (m/f/d): Analysis of Microscopic BIOMedical Images (AMBIOM) A new project area in the institute is the development of artificial intelligence (AI) software for topology-informed biomedical image analysis and large foundation models. You will be responsible for: Develop new machine learning algorithms for microscopy image analysis problems (2D/3D/4D/5D), which are driven by real applications in life science research Develop solutions to integrate large foundation models into microscopy image analysis and analytical data analysis workflows, together with other team members Implement AI-based microscopy image analysis software as python packages Develop algorithms to integrate topology constraints in AI models Report findings and methods in conference and journal papers Your profile: Masters, Diploma or equivalent degree in IT/computer science/statistics/applied mathematics/data science/biomedical engineering or of relevant scientific field A solid background in machine learning Extensive experience with either computer vision or image analysis Good knowledge of deep learning packages, PyTorch Familiar with foundation models (vision large models or multi-modal large language models) Basic knowledge of topology concepts Good presentation and writing skills Proactive, independent, and solution-oriented way of working Fluent English (spoken and written) Publications at top-tier computer vision conference or journals is a plus Experience with open-source software development is a plus We offer: A clear research topic as well as multifold training and support for PhD students in framework of ISAS and the Leibniz association Training and scientific development opportunities in an international environment and an excellent working atmosphere in a very dynamic and professional team Extensive state-of-the-art equipment and infrastructure in various analytical methods The opportunity to present your data on international conferences and participate in workshops A wide range of opportunities for further training and qualifications Flexible working times, mobile working and attractive social benefits Support in finding balance between work and family life (including finding childcare facilities, advice on caring for relatives) through a family service Workplace health promotion and support for participation in TU Dortmund University sports activities Non-residents who apply for this job will receive help from the institute to find accommodation and to handle authorities. Applications from disabled applicants are welcome. ISAS supports the principle of equal opportunity for all employees and therefore particularly encourages women to apply. The salary will be according to the German TV-L. The full-time position is offered for 3,5 years. The position is available immediately. The time limitation of the contract is based on the Wissenschaftszeitvertragsgesetz (WissZeitVG). ISAS collects and processes the personal data of its applicants in accordance with European and German legal regulations. Further information on data protection and the processing of personal data can be found at www.isas.de/datenschutzhinweise-fuer-bewerberinnen-und-bewerber. The closing date for applications is March 5, 2025. Please apply via our applicant portal. Informal requests (reference number 341_2025) are welcome and can be directed to the Human Resources team (bewerbungenisas.de). Further information about the institute can be found at: http://www.isas.de/en.